3 listopada 1995 roku dzięki inspiracji ówczesnego Prezydenta Miasta Gdańska Tomasza Posadzkiego oraz Konsula Generalnego w Toronto Andrzeja Brzozowskiego w Polskim Centrum Kultury im. Jana Pawła II w Mississauga zawiązał się komitet organizacyjny obchodów milenijnych Gdańska na terenie torontońskiej metropolii.
Chciano przypomnieć Polonii o wspólnych korzeniach i tradycjach, a kanadyjskiej społeczności przybliżyć ciekawą historię, przepiękną architekturę i kulturowy dorobek Gdańska.
W 1997 roku pierwotnie zawiązany komitet organizacyjny obchodów 1000-lecia Gdańska na terenie torontońskiej metropolii przekształcił się w Stowarzyszenie Gdańszczan w Kanadzie na czele którego stanęła Zuzanna Stupak - absolwentka Wydziału Humanistyki Universytetu Gdańskiego.
Do Stowarzyszenia wstępowali rodowici gdańszczanie, ludzie związani z Gdańskiem poprzez szkołę, pracę a także Ci, których Gdańsk oczarował swoim pięknem.
Stowarzyszenie Gdańszczan w Kanadzie zarejestrowane jest w Ministry of Consumers jako Non Profit Organization i współpracuje z wieloma organizacjami polonijnymi na terenie metropolii Toronto.